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科研进展

何春江团队解析年龄相关的免疫和基因表达变化

访问次数:发布日期:2021-07-29

近日,Briefings in Bioinformatics 在线发表了华中农业大学威尼斯论坛555503|首頁(歡迎您)何春江教授课题组研究论文,题目为“ADEIP: an integrated platform of age-dependent expression and immune profiles across human tissues”。该研究搭建了一个平台ADEIP,用于展示和检索年龄相关的基因表达和免疫图谱。


1. ADEIP的界面和开发流程


ADEIP包括来自GTEx计划中30个主要人体组织超过16000个样本的基因表达数据,这些样本来的年龄范围在20-80岁之间的捐赠者。该研究对不同年龄组的差异表达基因和基因集、免疫相关基因和免疫细胞组成等几个方面进行了整合分析。同时对已知与SARS-CoV-2和人类间充质干细胞(hMSC)相关的基因进行了举例分析,展示了ADEIP的相关应用。作为一个比较全面的平台,ADEIP可用于研究与衰老相关的表达和跨组织的免疫地图,有助于了解与年龄相关的传染病或遗传疾病的机制,从而开发个性化的治疗方案。

华中农业大学信息学院研究生刘旋和武汉大学基础医学院陈文博为该论文共同第一作者,华中农业大学威尼斯论坛555503|首頁(歡迎您)何春江教授、德州农工大学韩冷教授和华中农业大学威尼斯论坛555503|首頁(歡迎您)董志强教授为共同通讯作者,华中农业大学信息学院章文教授参与研究。


全文链接:

https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbab274/6319933



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